Eine vergleichende Studie der mikrobiellen Gemeinschaft Buchkatalog

Ziel dieses Projekts ist es, die mikrobiellen Gemeinschaften des 33 Jahre alten, sanierten Bodens in Monahan mit dem ursprünglichen Boden in O'Malley zu vergleichen. Mit den im Rahmen dieses Projekts gesammelten Daten soll untersucht werden, ob es einen Zusammenhang zwischen dem Alter des Bodens und der mikrobiellen Gemeinschaft im Boden gibt. Die DNA-Analyse des Bodens ist eine Möglichkeit, die mikrobiellen Gemeinschaften im Boden zu vergleichen. Aus mehreren Proben von zwei Standorten (sanierte und ungestörte Böden) wurde mithilfe eines DNA-Isolierungskits Boden-DNA isoliert. Unter Verwendung der Gemeinschafts-DNA als Vorlage wurden eubakterielle, archaeische und pilzliche DNA-Fragmente mit spezifischen Primern PCR-amplifiziert. Es wurden Versuche unternommen, das gereinigte Amplikon zu klonen. Ein weiterer Ansatz, der sich auf kultivierbare Isolate stützt, wurde ebenfalls verfolgt. Parallel zur kulturunabhängigen molekularen Technik wurden die Bodenproben von der ungestörten Stelle aufbereitet, um bakterielle Isolate auf Nährböden zu identifizieren. Die erhaltenen Isolate wurden mit bereits isolierten und identifizierten bakteriellen Isolaten aus der sanierten Fläche mittels Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus verglichen. Auch die Bakterienkonzentration wurde mit derjenigen der sanierten Bodenproben verglichen.